I Tyskland er det utstedt en arrestordre på ham. Da Israel nektet ham gjennomreise for å komme tilbake til Ramallah, hvor han bor, sa han ifølge Jerusalem Report: «Hver [palestiner] er skyldig for det som hendte i München, akkurat som jeg er. Israel vil måtte deportere omtrent 1.000 personer med Abu Amar [Yasser Arafat] i spissen. Det vil si at dere [israelere] sitter igjen med [Hamas-lederen] sjek Yassin.»
Tidligere har PLO nektet ansvar for denne udåden, og lagt skylden på en organisasjon de kalte Svart september. Men det er nå klart at denne organisasjonen bare var en dekkorganisasjon for PLO.
Noe lignende er blitt endelig bekreftet under Israels aksjon på Vestbredden etter PLOs påskemassakrer på sivile israelere. Det er funnet en rekke dokumenter som endelig knytter Arafat til selvmordsbomber og annen terror. Og da ikke bare slik at han har gitt støtte til det i prinsippet og i generelle ordelag (det har han gjort mange ganger offentlig). Det viser seg at Arafat selv og kretsen rundt ham har støttet og godkjent helt ned på detaljnivå.
